Naczelna Dyrekcja Archiwów Państwowych jest centralnym urzędem administracji rządowej, dysponentem środków budżetowych drugiego stopnia.

Działalność finansową Naczelnej Dyrekcji Archiwów Państwowych określa ustawa z dnia 30 czerwca 2005 r. o finansach publicznych (tekst jednolity Dz. U. z 2005 r. Nr 249, poz. 2104 z późniejszymi zmianami).

Majątek Naczelnej Dyrekcji Archiwów Państwowych stanowi własność Skarbu Państwa i może być wykorzystywany jedynie do celów związanych z działalnością statutową jednostki.

Naczelna Dyrekcja Archiwów Państwowych posiada majątek (aktywa trwałe) o łącznej wartości: 11.786.442,94 zł, w tym:

- nieruchomości o wartości: 697.129,12 zł (należący do Skarbu Państwa budynek siedziby NDAP w Warszawie przy ul. Długiej 6, znajdujący się w nieodpłatnym zarządzie Naczelnej Dyrekcji Archiwów Państwowych),
-   urządzenia techniczne i maszyny o wartości: 498.681,67 zł,
-   środki transportu: 48.411,94 zł,
-   inne środki trwałe: 49.516,86 zł,
-  inwestycje rozpoczęte: 10.492.703,35 zł (remont i adaptacja budynku na nową siedzibę Naczelnej Dyrekcji Archiwów Państwowych)
oraz aktywa obrotowe:
w tym: zapasy (wydawnictwa) 836.152,67 zł.

Wartość majątku oszacowano według wartości netto na podstawie bilansu za rok 2007.

Do składania oświadczeń w zakresie praw i obowiązków majątkowych oraz podejmowania zobowiązań finansowych upoważnieni są: Naczelny Dyrektor Archiwów Państwowych oraz Dyrektor Generalny lub ustanowieni przez nich pełnomocnicy.